Bölüm kurulduğu tarihten bu yana:
►Biyomühendislik ve biyoteknoloji alanındaki gelişmelere, yeniliklere katkıda bulunmak ve öncülük etmek, yeni gelişmelere ve atılımlara ayak uydurabilecek iyi eğitimli, aydın mühendisler yetiştirmek,
►Biyomühendislik alanında ulusal ve uluslararası kuruluşlarla sıkı iletişim ağları kurarak nitelikli ve çağdaş eşdeğerleri ile rekabet edebilecek düzeyde araştırma ve eğitim sistemleri geliştirmek ve gerçekleştirmek ilkelerini benimsemiştir.